Cet extrait du blog de Marc Gozlan dans « Réalités biomédicales » montrent que les certitudes affichées par certains, y compris certains scientifiques de renom, sortent du domaine scientifique et appartiennent plutôt au domaine « politique » voire à la promotions d’intérêts privés.
« Une équipe de chercheurs américains a établi une cartographie de toutes les mutations entraînant un changement d’acide aminé dans une petite région de la protéine spike de l’enveloppe du SARS-CoV-2. Baptisée RBD (domaine de fixation au récepteur, receptor binding domain), cette zone est celle qui permet au coronavirus de s’arrimer au récepteur ACE2 présent sur les cellules cibles. Lors de l’entrée du virus dans les cellules cibles, le RBD de la protéine spike joue donc le rôle de clé, alors que le récepteur cellulaire ACE2 correspond à la serrure.
Parmi toutes les mutations identifiées dans le RBD, certaines contribuent à ce que les anticorps présents dans le sérum de patients infectés ne se fixent pas sur cette petite région. De fait, ces travaux montrent que, lors de l’infection naturelle, certaines mutations du RBD peuvent avoir pour conséquence de réduire fortement l’activité neutralisante des anticorps vis-à-vis du virus.
Allison Greaney et ses collègues du Fred Hutchison Cancer Research Center et de l’université Washington (Seattle) se sont intéressés à l’impact des changements en acides aminés de la région RBD provoquées par des mutations sur la production des anticorps lors de l’infection naturelle, ce que l’on appelle la réponse humorale. Même si le rythme des mutations des coronavirus est plus lent que celui d’autres virus à ARN, dont celui de la grippe, il n’en demeure pas moins que le SARS-CoV-2 subit une évolution antigénique et qu’il importe de déterminer quelles mutations influent sur l’efficacité des anticorps produits en cas d’infection naturelle.
Plusieurs études ont montré que la plupart des anticorps dits neutralisants, car empêchant l’infection de nouvelles cellules, ciblent une région particulière de la protéine spike de l’enveloppe virale. Parmi l’ensemble des anticorps produits par le système immunitaire lors de l’infection naturelle par le SARS-CoV-2, ce sont les anticorps dirigés contre le RBD qui sont principalement responsables de l’activité neutralisante vis-à-vis du SARS-CoV-2. En d’autres termes, le RBD est la région du virus la plus importante en termes de pouvoir neutralisant des anticorps.
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Les expériences réalisées ont montré que l’activité neutralisante du sérum de ces patients convalescents était essentiellement assurée par les anticorps anti-RBD. En effet, lorsque les chercheurs les éliminaient artificiellement du sérum cela se traduisait par une diminution drastique de l’activité neutralisante du plasma. De fait, l’activité neutralisante du sérum était essentiellement due aux anticorps dirigés contre le RBD dans la majorité des échantillons de sérum testés (33 sur 35). Surtout, l’activité neutralisante du sérum était diminuée de plus de 90 % dans un tiers des échantillons de sérum (13 sur 35) après retrait des anticorps anti-RBD. »